Em novas pesquisaspublicado esta semana em Ciênciaos pesquisadores analisaram a composição do microbioma intestinal de bebês nascidos em comunidades de caçadores-coletores e nações industriais e encontraram diferenças na composição colonial do microbioma intestinal.
Eles descobriram que após quase seis meses desde o nascimento, bebês de nações industrializadas começam a perder uma importante comunidade bacteriana chamada Bifidobacterium infantis, que é essencial para ajudar os bebês a digerir o leite materno. Os pesquisadores suspeitam que a perda de uma bactéria tão essencial possa estar ligada ao aparecimento de muitas doenças imunológicas e alérgicas.
“Se entendermos como o desenvolvimento infantil ocidental difere de outras populações, podemos até começar a pensar e possivelmente decifrar os padrões de desenvolvimento do microbioma e como as condições imunológicas ou alérgicas começam a surgir”, diz Matthew Raymond Olm, principal autor do estudo e microbiologista computacional que trabalha na Laboratório de Justin Sonnenburg.
Usando o sequenciamento moderno
A maioria dos pesquisadores acredita que quando um bebê nasce, seu microbioma intestinal é quase estéril.
“Nos primeiros meses, a composição do microbioma intestinal dos bebês de ambas as sociedades – caçadora-coletora e industrial – tem uma composição semelhante”, diz Aashish Jha, coautor do novo estudo e microbiologista da New York University Abu. Dhabi.
Essa semelhança decorre de uma dieta homogênea que os bebês têm. Eles comem principalmente leite materno e não são expostos a ambientes externos. Nesse período, o consumo de leite Bifidobactérias domina seu microbioma.
“Mas depois de seis meses, em bebês industrializados, o microbioma começa a se desenvolver de forma diferente. Enquanto nas populações rurais tradicionais seguem a mesma trajetória [of first six months] até quase três anos”, diz Jha.
O laboratório de Sonnenburg na Universidade de Stanford está liderando a nova pesquisa como parte do projeto de microbioma intestinal. Em colaboração com algumas outras universidades em 2013, os pesquisadores foram até a terra Hadza, na Tanzânia, para coletar amostras de fezes.
“Usamos as mesmas amostras coletadas, mas fizemos um sequenciamento profundo moderno e avançado”, diz Olm.
Diferença nas práticas de amamentação
As técnicas tradicionais de microbiologia envolvem a análise de bactérias uma de cada vez, o que não é eficiente para a complexidade do microbioma intestinal.
“Quero dizer, há mais bactérias em nossos intestinos do que humanos na Terra”, diz Olm.
É por isso que Olm e seus colegas empregaram o sequenciamento metagenômico no qual “você apenas pega uma amostra de cocô e extrai todo o DNA dela”, diz Olm.
Em seguida, aplicam análises computacionais que podem identificar a fita de DNA de suas respectivas espécies. Os pesquisadores descobriram quais micróbios estavam presentes, com base em seu DNA.
Eles também descobriram que, após seis meses, mais de 20% dos micróbios detectados em bebês Hadza eram indetectáveis em bebês industrializados. Os pesquisadores suspeitam que a menor abundância de B. infantis em bebês industriais pode estar ligada a muitos fatores. Pode ser tão simples quanto a diferença nas práticas de amamentação.
“Nos países ocidentais, você consome compostos à base de fórmulas que não possuem os mesmos oligossacarídeos do leite humano que Bifidobactérias gostaria de comer”, diz Olm. E as mães têm uma grande influência, não apenas quando o bebê está no útero, mas durante os meses e anos de crescimento subsequentes após o nascimento.
Entendendo nosso ecossistema microbiano
“O artigo é importante porque os autores forneceram uma visão detalhada do microbioma proveniente de uma população humana tradicional que se assemelhava a algo que todos nós costumávamos se assemelhar a muitos milhares. [of] anos atrás”, diz David A. Relman, um microbiologista de Stanford que não esteve envolvido no novo estudo.
“Assim, a pesquisa ajuda a entender de onde viemos e como eram nossos microbiomas originalmente. É a história não só de nós como humanos, mas de um ser humano [microbial] ecossistema”, diz Relman.
Mas Relman também adverte que devemos ser pacientes. Os autores consideraram uma população de caçadores-coletores. Os pesquisadores devem continuar a fazer esforços deliberados para estudar muitas outras populações para ter uma compreensão robusta.
“Devemos ter cuidado para não generalizar demais a descoberta e assumir que todos os caçadores-coletores são como os Hadza”, diz Relman.
Muitas populações ocidentais sofreram de doenças crônicas. Há também pesquisas que sugerem uma causa potencial do microbioma inicial.
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